Séquençage

Le laboratoire de séquençage du Centre de Pharmacogénomique opère selon les Bonnes pratiques de laboratoire/Bonnes pratiques cliniques de laboratoire (GLP/GCLP) et offre des services à des clients appartenant aux milieux académique, industriel et pharmaceutique. Toutes les opérations sont effectuées selon des procédures opératoires normalisées (PON) et les détails des expériences menées sont documentés dans un LIMS. Le Centre de Pharmacogénomique est équipé d’instruments Illumina HiSeq et MiSeq, lui permettant d’offrir un large éventail de conceptions expérimentales, du séquençage du génome entier jusqu’au séquençage de précision. Au coeur de son expertise, le Centre de Pharmacogénomique possède une équipe de bio-informaticiens offrant un service complet d’analyse, d’interprétation et de communication de données.

Le Centre de Pharmacogénomique offre en outre des services de planification et d’évaluation de projets de séquençage.

Expertise fondamentale en séquençage

  • Expertise fondamentale en séquençage
    • Amplification par PCR
      • Agilent HaloPlex Custom (lien)
      • Illumina AmpliSeq (lien)
      • Bioo Scientific NEXTflex Small RNA (lien)
    • Amplification à base d’hybridation
      • Agilent SureSelect Custom (lien)
      • Roche-NimbleGen SeqCap EZ Choice (lien)
      • Nextera Rapid Custom Capture (lien)
  • Séquençage du génome entier
  • Capture d’exome
    • Agilent SureSelect Human All Exome (lien)
    • Roche-NimbleGen SeqCap EZ Exome (lien)

Technologies de séquençage

  • HiSeq 2500
    • Chimie V3 : jusqu’à 300 Gb de données ou 3 milliards de lectures « paired-end » par cellule de mesure (flow cell)
  • MiSeq
    • Chimie V2 : jusqu’à 8,5 Gb de données ou 30 millions de lectures « paired-end » par cellule de mesure (flow cell)
    • Chimie V3 : jusqu’à 15 Gb de données ou 50 millions de lectures « paired-end » par cellule de mesure (flow cell)

Pour nous joindre

Ian Mongrain, M.Sc.
Chef des opérations

Centre pharmacogénomique Beaulieu-Saucier
Institut de Cardiologie de Montréal, bureau S-2050
5000, rue Bélanger Est, Montréal
Qc, Canada, H1T1C8

Bureau : 514-670-7670, 7716
CA/USA : 1-855-670-7670, 7716
Télécopieur : 1-514-670-7671

ian.mongrain@pharmacogenomics.ca